Odottamattomien tapojen lisääntyminen äkillisesti. Loppun lähellä oleva maailma saa aikaan ennennäkemättömän pääetsivä !!! Tarina seuraa motivoitunutta etsivää Asano Misakia ja hänen löysää kumppaniaan Hijirihara Takumia. He työskentelevät erityisessä rikostutkintavirastossa (SCI), joka vastaa epänormaaliksi tai outoksi arvioiduista tapauksista. Sarjan kolmannen luvun keskellä paljastetaan, että Killer Killer on itse asiassa virallinen sivutarina Danganronpa-sarjalle, joka pidetään elokuvan ”Ultra Despair Girls - Danganronpa: Another Episode” jälkeen ja ennen “Super Danganronpa 3: Goodbye Despair Academy” -tapahtumaa ”
